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    菌絲外觀上呈白色絨毛狀,表面有一層白色結晶物。組成靈芝菌絲體的菌絲依其來源和形態可以分為三種:

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    1.初級菌絲:或稱一次菌絲。由擔孢子萌發后直接發育的菌絲,在每一個細胞內只有一個細胞核,菌絲較細,在整團菌絲中沒有鎖狀聯合。鎖狀聯合是擔子菌菌絲特有的結構,是菌絲線形細胞分裂的一種方式。初級菌絲依靠孢子內貯存的營養來維持生長,故壽命很短。

    2.次級菌絲:或稱作二次菌絲。它是由不同性別的擔孢子萌發的一次菌絲相互融合而成。其中一條菌絲中的一個細胞核移到另一條菌絲的一個細胞中,形成一個有不同性別的兩個細胞核的雙核菌絲。二次菌絲對基質的侵染能力較強,并能在基質中形成菌絲體。由二次菌絲形成的菌絲體中可見鎖狀聯合。只要基質中營養充分,二次菌絲形成的菌絲體的壽命可以達到幾年、幾十年。

    3.三級菌絲:或稱作三次菌絲。次級菌絲形成的菌絲體生長到一定階段達到生理上成熟后,就會有些菌絲在基質的表面上扭結形成原基,由原基再發育成子實體。這些構成子實體的菌絲就是三次菌絲。三次菌絲的菌絲體結構與二次菌絲體有很大差別,這種菌絲間隙較小,并出現組織和器官的分化如菌柄、菌傘等。

    靈芝子實體是一傘形的菇狀物,呈紫紅色或棕紅色。其質地幼時為肉質,成熟變干后為木栓質。子實體由菌蓋(菌傘)和菌柄構成。靈芝的菌傘多在菌柄頂端一側發育,菌柄位于菌傘的一側。

    靈芝菌柄呈不規則圓柱形,有時稍扁且有些彎曲,生長中的兩個菌柄一旦接觸就很容易長合成為一個粗的菌柄。菌柄呈紫紅色,向光的一側顏色較深。菌柄的粗細、長短隨生長環境條件改變。營養充足時,菌柄發育較粗,反之,發育較細。在通氣良好的條件下,菌柄發育得很短,在氧氣不足、二氧化碳濃度大時,菌柄發育細長。

    靈芝子實體的菌蓋和菌柄的內部結構是相似的,但菌柄無菌管層,它們的微結構如下:

    1.皮殼層:由三層構成:

    (1)外層是由許多排列緊密、比較粗的菌絲組成。菌絲的尖端向外平行排列成柵狀,與菌蓋垂直,細胞壁較厚,內充滿樹脂及色素,構成蓋面的顏色及油漆狀的光澤。

    (2)中層是由粗大的厚壁菌絲交織排列而成。菌絲內部有棕紅色的樹脂質,可使菌蓋呈現顏色。蓋面顏色呈紫紅色的子實體,其中層較厚。發育不夠正常、蓋面顏色較淺的子實體,其中層較薄。

    (3)內層是由一些不含有樹脂質或色素的菌絲交織組成。其細胞壁也比較厚,是皮殼到菌肉的過渡帶。

    2.菌肉層:由一些液泡體積較大的菌絲交織組成,由于這些菌絲排列松散,稀疏地交織在一起,間隙較大,使菌肉呈現出木栓質的特征。

    3.菌管層:由許多平行排列的管狀結構組成。菌管壁是由許多菌絲平行排列而成。這些菌絲末端皆膨脹如大茄梨形—擔子。擔子壁很薄,細胞質稠密,內含兩個細胞核。隨著子實體的生長,擔子也逐漸成熟;擔子內的兩個細胞核相互融合成一個核,完成核配,繼而連續進行兩次有絲分裂,完成減數分裂,產生四個子細胞核。同時,擔子小梗成錐體狀,頂端尖,在這個尖頂處又膨大產生一個卵圓形的擔孢子。當擔孢子發育成熟后,在擔孢子與擔子小梗尖處產生一個液泡;液泡吸水膨脹至破裂,擔孢子則被液泡破裂時產生的機械力量彈射到菌管的空腔中,并分散出去。

孢子在顯微鏡下觀察到的擔孢子呈卵形,棕色,約(8-2)μmX(5-7)μm大小。孢壁雙層,外壁平滑、無色透明,內壁深棕色,有小棘突。由內壁保衛的空強里面充滿濃稠的細胞質,細胞質中有一個細胞核和一個黃色至亮黃綠色的油滴(見圖24)。在電子顯微鏡下,孢壁外層表面有許多小凹坑及小孔。

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